FEE heeft enkele grote programma’s die wereldwijd worden gebruikt. Dit betreft twee programma’s voor recreatie en toerisme (Blauwe Vlag en Green-Key) en drie programma’s voor het onderwijs (Eco-Schools, Young Reporters for the Environment en Learning about Forests).

Voor alle programma’s geldt dat er een award verdiend kan worden. De criteria van de awards zijn internationaal gelijk en worden door een nationale en internationale jury beoordeeld. Tussentijds worden ook controles uitgevoerd. De programma’s bestaan uit een generieke aanpak met de mogelijkheid om per land er specifieke dingen aan toe te voegen.